Система керування є основним компонентом вертикального обробного центру. Він приймає команди оператора та керує рухом різних компонентів машини. У системах керування зазвичай використовуються високо-системи ЧПК, які забезпечують складні шляхи обробки та точне позиціонування. Завдяки точному керуванню системою керування вертикальні обробні центри можуть досягти високо-точної обробки, значно підвищуючи ефективність і якість виробництва.
